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民国二十一年（1932年）后，任红四军第十师第二十九团第一营政治委员、团政治处主任，红三十一军第九十二（后九十三）师政治部主任，红四军政治部主任。参加了红四方面军西征，参加了枣阳、新集、漫川关、王曲、子午镇、仿（金旁加皇）镇等战役战斗。

在川陕革命根据地，任师政治部主任、军政治部主任，参加了粉碎四川军阀“三路围攻”、“六路围攻”的斗争和仪南、营渠、宣达三次进攻战役，为创建川陕革命根据地作出了贡献。他率部参加并参与指挥了空山坝、三江坝、旺苍坝和万源保卫战等重大战役。他创造性地开展思想政治工作，成效显著，受到方面军领导的表扬。

民囯二十四年（1935年）3月，随红四方面军长征。他率部参加强渡嘉陵江、土门、包座、绥崇丹懋、天芦名雅邛大等战役，并负责方面军的后方收容和筹措粮草等工作。他正确执行党的民族政策，对少数民族头人积极开展统战工作，获得了少数民族兄弟的支持，解决了红军的粮草供应，扩大了红军在少数民族地区的影响。1935年7月，奉命接应中央红军，组织筹措了大批军需物资，受到刘少奇的赞扬。

民国二十五年（1936年）10月，进入红军大学学习，先后任抗日军政大学第三大队一支队支队长、第四大队副大队长、四团团长、五分校副校长。

抗日战争

民国二十八年（1939年）7月，率第三大队学员随抗大总校开赴太行山抗日前线，参加了百团大战和粉碎日伪军大规模“扫荡”的战役战斗。

民国二十九年（1940年）11月，率抗大总校华中派遣大队奔赴苏北抗日前线，冲破敌人重重封锁，跨越晋、冀、鲁、豫、皖、苏6省，于1941年4月到达江苏盐城新四军军部，全队无一减员，受到刘少奇政委、陈毅代军长的高度赞扬。随后任抗大第五分校副校长。在陈毅校长领导下，坚持抗大办学方针，为新四军培养了大批干部。

民国三十年（1941年），夏季反“扫荡”斗争，临危受命，掩护新四军军直机关和抗大五分校安全转移。同年10月，任新四军盐阜军区司令员，领导盐阜军民开展反伪化、反蚕食斗争，发展壮大地方武装，受到华中局特令表彰。

民国三十一年（1942年）12月，调任新四军第三师参谋长，协助黄克诚师长兼政委指挥了夏季攻势作战和苏北反顽斗争，胜利粉碎了敌人的“扫荡”，并歼灭大批日伪军，扭转了不利态势，巩固了苏北抗日根据地。民国三十四年（1945年）8月，苏北我军转入反攻，他参与指挥了解放阜宁、车桥、淮阴、淮安的战斗，为夺取抗日战争的最后胜利作出了贡献。

解放战争

民国三十四年（1945年）9月，洪学智任新四军第三师副师长，与黄克诚率部进军东北，执行党中央“建立巩固的东北根据地”的战略方针，在极为困难的情况下疏通了承德到辽西的铁路，确保及时输送大批干部和部队进入东北。

民国三十五年（1946年）2月，任辽西军区副司令员，率部参加了攻打通辽、中长路阻击战、四平保卫战等战役战斗，遏制了敌人战略进攻势头。7月后，任黑龙江军区司令员，领导剿匪斗争并取得胜利，巩固了北满根据地。后担任东北民主联军第六纵队司令员，率部参加三下江南的作战。

围攻城子街，全歼敌新一军八十九团。强攻德惠坚固设防之敌，在东北战场上第一次指挥步兵、炮兵、坦克诸兵种协同作战，为我军向国民党主力军进行正规攻城作战取得了经验。又率部参加东北夏、秋、冬季三次攻势作战。在夏季攻势中，他率六纵在友邻部队配合下，全歼国民党新一军三十八师一一二团，又追歼敌暂编第二十一师。

率部与兄弟部队配合进行四平攻坚战，与敌血战15昼夜，给国民党守军以沉重打击。在秋季攻势中，连拔敌吉林外围据点，击毙敌二师少将师长，为攻取吉林创造了条件。在冬季攻势中，与兄弟纵队配合，取得了新立屯战役胜利，围歼国民党精锐部队新五军，给蒋介石和国民党军以极大震撼。他率部运动歼敌，接连攻克辽阳、鞍山、营口等重镇，全歼敌五十四师和二十四师等3万余人，受到毛泽东主席和东总领导来电嘉奖。

民国三十七年（1948年）11月，洪学智率领部队参加平津战役，先截断平津之敌联系，封堵了北平敌人海上逃跑之路；同时遣所部主力十七师参加天津攻坚战，为平津战役胜利作出了贡献。此后，他任四十三军军长，率部作为四野先遣兵团南下，途中被任命为第四野战军第十五兵团第一副司令员。